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1.廣州(1925.7.1-1927.1.1)由廣州的護法軍政府改組。

2.武漢(1927.1.1-1927.8.22)1927.8.22遷往南京與南京國民政府合併。

3.南京(1927.4.15-1927.8.22與武漢國民政府合併)

2與3為寧漢分裂的關係，故有兩個國民政府，後南京國民政府取消，武漢國民政府遷往南京

4.南京(合併後，1927.8.22-1937.11.27)

5.重慶(1937.11.27-1946.5.1)名為陪都，實為實際首都。因對日抗戰，故遷至重慶。

6.南京(1946.5.1-1948.4.25)

7.廣州(1948.4.25-1949.10.12)

8.重慶(1949.10.12-1949.11.28)

9.成都(1949.11.28-1949.12.10)

10.台北(1950.3.1-今)

7-10均因國共內戰，國軍失利而遷移。

其他中華民國國民政府：

1.中華民國國民政府(擴大會議)──北京(1930.9.1-1930.10)

2.中華民國國民政府(寧粵分裂)──廣州(1931.5.27-1932.12.15)

3.中華民國(偽南京)國民政府(汪兆銘)──南京(1940.3.30-1945.8.12)此為日本扶植的傀儡政權

寧漢分裂，係指1927年國民黨黨內因對共產黨問題產生歧見，導致成立兩個國民政府與國民黨中央相互軍事對峙的局面。事件起因於1926年的中山艦事件，國民黨內部各派便因對共產黨的態度問題，引起了一場軍事政變，最後在蔣介石軍事領導下，重新調整國共兩黨的關係。在《整理黨務案》中，將國民黨的「容共」方針轉為「聯共」，嚴禁跨黨份子。自中山艦事件後，國民黨左派對於蔣介石軍事獨裁的可能更為防範，因此隨著北伐軍事的推展，國民黨左派便積極限制蔣介石的軍事權力，但遭到失敗。在北伐中，國民黨議決遷都武漢，蔣介石本表贊成，卻在部分國民政府委員通過江西時，加以軟禁，於是武漢政府與南昌方面產生爭執。當國民革命軍攻克南京時，雙方的爭議更不斷擴大，於是蔣介石於1927年3月24日 於南京另外成立國民政府，於是國民政府分裂為二(武漢與南京)。在南京的國民政府力行清黨，對管轄區內的共產黨份子或可疑份子均加以捕殺，而武漢國民政府則繼續堅持聯共政策。兩個國民政府一開始為了表明自身的正統性，因此雙方可以說是在彼此競爭北伐。武漢政府北伐河南其用意在取得北方友軍(馮玉祥)的支援，此舉在軍事上雖然獲得成功，但馮玉祥卻因面臨張作霖的軍事壓力，而亟欲武漢與南京並力北伐，因此對武漢與南京保持中立。武漢政府在得不到外援，且長江出海口遭到南京方面控制的局面下，經濟上受到嚴重的打擊。同時，共產黨在湖南農村中過火的行為，不但動搖了武漢國民政府的統治基礎，更影響了武漢方面軍人的士氣，於是湖南軍隊何鍵部便公開對共產黨人開火，引發了「馬日事變」，此後武漢的國共聯合戰線便趨於瓦解。武漢政府遭到接受南京政府的各軍包圍，加上經濟失控、軍隊不聽調度，於是宣布分共，禮送共產黨員離開，此即「武漢分共」。並開始與南京國民政府和談，議決武漢國民政府遷至南京，蔣介石復職(在寧漢分裂期間，因外部壓力而下野)於是兩個國民政府重新合而為一。

寧粵分裂，1931年蔣介石以政見不合，無故扣壓黨國大老胡漢民於湯山溫泉，史稱「湯山事變」。廣東籍黨國政要為此南下廣州，聯合廣東軍人陳濟棠，在廣州成立國民政府與非常會議，中國分裂為南京國民政府與廣州國民政府兩個政府，史稱寧粵分裂。1932年，寧粵雙方議和，重新恢復統一，但兩廣地區成立國民黨西南執行部、西南政務委員會，持續保持半獨立狀態，並以抗日為訴求，與南京國民政府對抗，直到1936年，陳濟棠軍事集團為蔣介石收買、分化而瓦解，陳濟棠被迫下野出走，廣東回歸中央，方告終止。後，蔣介石本欲趁機解決廣西(李宗仁)，但因對日抗戰爆發，雙方協議共同抗日，蔣桂之間的戰爭遂消失於無形。

二.

國民黨系統的演變：

興中會→同盟會→國民黨→中華革命黨→中國國民黨

1919年，中華革命黨因倒袁已經成功，因此改組為中國國民黨，將其政黨性質由革命政黨，轉變為民主政黨。然而，1924年孫文採取聯俄政策，採納蘇聯顧問的意見(此次改組由蘇聯顧問鮑羅廷主導)，將中國國民黨改組為蘇式政黨(共產黨式的政黨)，此次改組並為改變黨名。後，雖然歷經中山艦事件、寧漢分裂、中原大戰等重大政治事件，但大抵黨組織未有太大的更動。直到國民黨來台後，蔣介石檢討喪失大陸的原因，因此成立中國國民黨改造委員會進行黨內改造，但此次的改造除了加強蔣介石的個人黨內威權，與排除部分黨內派系外，對於國民黨組織仍舊分毫未動。